1、牡丹种子的采集
牡丹果实在8月中下旬至9月上旬陆续成熟，当果实呈蟹黄色，腹部开始破裂时分批采收，采收后摊放阴凉通风处，使种子在果荚内充分成熟，应经常翻动，以免发热。待果荚充分开裂后，随即脱粒播种，或者将种子置室内通风处阴干保存备用。
2、牡丹种子的形态
牡丹种子阔椭圆状球形或倒卵状球形，长10.3～12.1毫米。宽8.6～9.8毫米，表面黑色或棕黑色，有光泽，常具1～2个大型浅凹窝，基部略尖，有一不明显小种孔，种脐位于种孔一侧，短线形灰褐色。外种皮硬、骨质，内种皮薄、膜质。胚乳半透明，含油分，中间有一空隙。胚小直生，胚根圆锥状，子叶2，近圆形。千粒重198克。
3、牡丹种子的贮藏
牡丹种子宜随采随播，如不能及时播种，可将种子用湿润沙土分层堆积于阴凉处，但贮藏时间不能超过9月份，一般贮藏条件下贮藏期限为1年。牡丹种子为下胚轴休眠类型，收获时胚还未完全发育成熟，胚发育早期要求较高温度(15～22℃)30天，后期要求30～40天的10～12℃的低温。胚形态上发育完成后长根，又需要15～20天在o～5℃低温条件下打破下胚轴休眠，下胚轴休眠打破后，可在10～20℃温度下长茎出苗。
4、牡丹的选种
牡丹播种前应将种子放在水中进行选种，去掉浮水杂质及不成熟种子，取下沉、大粒饱满种子用50℃温水浸种24小时，或用95%酒精浸30分钟，再与湿草木灰拌后立即进行播种。如因下雨不能播种，切记勿将潮湿种子放在密闭容器中，以免种子霉烂。可将种子堆放在室内潮湿地面上，用湿布盖之，或将其用湿土或湿砂混拌后堆放，待天晴再播。
牡丹种子具上胚轴休眠现象，秋季生根，春季发芽，若温室播种，可用500×10_6～l 000×10“浓度的赤霉素浸种24小时，可有效解除休眠，进行播种。